在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
平凡少年韩立出生贫困，为了让家人过上更好的生活，自愿前去七玄门参加入门考核，最终被墨大夫收入门下。 墨大夫一开始对韩立悉心培养、传授医术，让韩立对他非常感激，但随着一同入门的弟子张铁失踪，韩立才发现了墨大夫的真面目。 墨大夫试图夺舍韩立，最终却被韩立反杀。通过墨大夫的遗书韩立得知了一个全新世界：修仙界的存在。 在帮助七玄门抵御外敌之后，韩立离开了七玄门，前去墨大夫的家中寻找暖阳宝玉解毒，并帮助墨家人打败了敌人。 通过墨大夫之女墨彩环的口中得知太南小会地址，韩立为追寻修仙人的足迹决定前往太南小会，拜别家人后……
在这个世界上，有无数以人的生机为食的不死怪物，千万年以来都有修习法术之人与他们对抗，但都以失败告终，直到三真法门的出现，三位传人，在三个时代同时针对不死尸作战，他们是这活者与死者战争中唯一的胜算。
暂别苍风帝国，云澈来到神皇帝国开始新的冒险，意外与凤凰神宗弟子结下梁子，同时也结识了凤凰神女，雪公主，凤雪儿，又遭鬼影圣手花铭海跟踪，不打不相识。天玄七国排位战开始，云澈动身参战，这将是云澈展现实力的新舞台，还是陷入恶斗的苦战场？云澈身藏的凤凰血脉，又将在神凰帝国引发何等风波？风云诡谲，尽在云澈一念之间。
超人们在执行任务的过程中陷入大危机，一个神秘人出现夺走同伴的能量，为救回同伴，小心超人一路追凶，跨越时空，意外坠入一个全新的世界，在这里他经历了重重冒险……神秘人的目的究竟是什么？小心超人该如何救回自己的同伴呢……
