《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
在大海的最深处，藏着所有秘密。一位现代少女（参宿）误入梦幻的深海世界，却因此邂逅了一段独特的生命旅程。
西域妖族少年撞上腹黑神秘的香料铺掌柜，是好心收留，还是另有目的？寻香之路上的各种怪谈奇遇，围绕两人展开……
故事发生在美丽的青藏高原，人迹罕至的雪域冰川是动物们唯一赖以生存的家园。呶噜是一只刚刚出生没多久的藏羚羊，跟随着母亲的脚步，它们正在进行一年一度的繁殖之旅，即将回到家乡。然而，就在这个节骨眼上，邪恶的偷猎者们出现了，在他们的追捕之下，呶噜的母亲不幸跌落山崖，幸运的是呶噜逃过一劫。 在万里无垠的广袤大地之上，寒冬即将来临，呶噜孤身一人，不知该何去何从。兔鼠卡拉和百灵西达的出现给呶噜带来了希望，在它们的陪伴之下，呶噜开始学习起了生存必要的技能。冬天过去了，呶噜的头上长出了稚嫩的羚羊角，它决心凭借自己的力量，返回家园。
元藏是天选伏魔师后人，十余年前魔族势力陆王手下的狐娇率兵前来为夺取大胜将伏魔师灭族，父亲临死前将幼年大胜与金箍棒托付给了自己的儿子元藏。逃走后的元藏继承了父亲遗志在人界降妖伏魔守护一方太平。大胜成年后两兄弟便踏上了为父复仇的道路，而在这过程中兄弟两遇到了仙界使者小八与阿沙，在得知神魔大战的故事和自身的宿命后，两兄弟与众人毅然决然结伴而行，踏上了寻找七十二元神碎片复活斗战胜佛的征程。
没头脑和不高兴是一对活宝，一个做事丢三落四忘东忘西，一个常常拿着一根竹竿做出一副不高兴的模样，当旁人感慨他们长大后该怎么办时，两人就想立刻长大做出一番事业给旁人瞧瞧，结果，一瞬间两人真的长大成人，没头脑当了工程师，不高兴成了演员。 没头脑设计的千层少年宫建成后，只有九百九十九层，原来他少设计了一层，而小朋友们排着队去少年宫看演出时，没头脑发现他们都是一副奇怪的装扮，原来他不但把喷水池设计在了大厅中央成了喷雨池，还搞忘了把电梯画进图纸，他们要爬整整一个月的楼梯才能看到演出。演出现场，扮演老虎的不高兴很不高兴演老虎，于是在演出时，老虎不但打不死，反打起武松来。——到头来，他们长大后还是没头脑和不高兴。
