Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
“瞒着妻子……会害怕吗？ ” 礼司和妻子、亲友夫妇一起访问了旅馆4天3夜。 明明是以和妻子生孩子为目的的，却被喝醉了的人妻（青梅竹马）从房间里带走了…… 而且本应是贞淑的妻子，在拉门的对面，对挚友……。 在本应该是夫妇一起睡觉的被子里，和别的对象依偎在一起的4人 沉溺于被禁止的“夫妇联欢旅行”——
女高中生铃木的个性开朗、交友甚广、擅长察言观色，是班上的中心人物之一，她喜欢的对象是坐在自己隔壁的男同学谷，而谷的个性与铃木恰恰相反，他内敛沉稳、有主见、待人一视同仁。铃木一直无法鼓起勇气告白，直到某日一个偶然机会，两人放学回家时走在同一条路上，并因此牵起了手。之后两人相互倾诉对彼此的好感，并开始交往，而同学们虽然感到讶异，但也都很支持两人的恋情。
曾经的一国之君意外身亡，穿越到魔法世界却成为手无缚鸡之力的婴儿？好吧，在壮阔而神秘的世界从零开始！比修炼更重要的是，他要先学会如何自己上厕所…离开襁褓成为强者，失去了尊贵王冠的他，用利剑为自己加冕！
憧憬着像漫画一样展开故事的前辈北滨瑛二，以及擅长扮演不同类型角色的后辈七仓凛。在同一戏剧部的二人将如何擦出火花？七仓凛能以真实的“自己”向前辈传达自己的想法吗？
舞台是东京新宿…… 樱花盛开的季节里，转校来到「真神学园」的迷团重重的男子「绯勇龙麻」。 就像被引导着一样，结识了剑道部的「蓬莱寺京一」，摔跤部的「醍醐雄矢」，射箭部的「樱井小蒔」，以及学生会会长「美里葵」。 他们受到突然或心活性化的《龙脉》的影响，《拥有的力量的人》觉醒了。 与此同时，同样受到龙脉影响的被叫做《鬼》的异形也出现了，并且开始了对东京的袭击。 并且，存在着使用《外法》操纵这些鬼怪的人。 为了保护东京的龙麻一行，不久又和要逃离自身的《宿星》相遇了……
小和尚一休生活在日本幕府时代，他勤奋好学，热心助人。一休由于天资聪颖、爱动脑筋，经常能将人们日常生活无法解决的问题聪明化解，于是英名远播。由于一休名声在外，经常就有一些需要帮助或者故意想刁难他的人会找上门来。热心的一休总是来者不拒，只要有问题相求，他总是会开动他聪明的脑筋解决问题。因此，无论是将军，桔梗店老板还是新右卫门先生总是难不到聪明的一休。一休解决问题，不仅让坏人们得到了应有的惩治，而且还会教会你很多生活中的窍门。
本作确定分割两季度放送
初中女孩佐佐木杏奈（高月彩良 配音）深藏无限的愁绪心事，她与疼爱自己的养母赖子（松岛菜菜子 配音）也无法坦然相对。由于上学期间突发过呼吸的情况，于是杏奈利用暑假来到了北海道釧路湿原地区的一座小镇，在亲戚大岩清正（寺岛进 配音）和阿节阿姨（根岸季衣 配音）家疗养。在叔叔家不远处的溪地，矗立着一座老旧但风韵独存的西式建筑，奇妙的感觉令杏奈注意到了它的存在。某个夜晚，心情低落的杏奈划着小船朝着该建筑划去，结果发现本该许多年没人居住的房子居然灯火通明，并且她在那里邂逅了与之年龄相仿的金发碧眼女孩玛妮（有村架纯 饰）。相似的心境让两个女孩成为好朋友，她们依恋着彼此，却不知各自的心底隐藏着怎样令人难以置信的因缘…… 本片根据英国小说家琼安·G·罗宾森的同名儿童文学改编。
突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。 本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。 世界的命运托付在了一位年仅14岁的少年身上，而“第二次冲击”所隐藏的“人类补完计划”似乎也开始了行动。掌握一切答案的碇元渡，却只是不动生色地观察，仿佛一切早已写入剧本。
野心勃勃的哈鲁马为了实现自己征服世界的阴谋，企图复活妖神古布力奇，而阿拉国公主米露则为了拯救阿拉国，竭尽全力寻找传说中的勇士拉姆斯，经过千心万苦的寻找和百般考验，米露确认阿宗就是传说中的勇士，并把他带到了飘渺世界，阿宗在那儿成功地复活了守护骑士斯卡夏王，不过阿宗得知还有另外七个守护骑士失散在各地，于是他与米露公主，叮叮公主一起踏上了寻找守护骑士的神秘旅程……
有一天，太阳的恩惠，也就是光变得微弱下来了，这可是大事件，这样下去，不可思议星将没有光，成为黑暗的世界！根据传说，为了让太阳的恩惠回到世界，需要只有太阳之国的公主才可以使用的魔法“prominence”。但是，能够拯救星球那样强力的prominence只有一名合格的公主才能够发动。
801飞行部队隶属于日本空军自卫队，是一支完全由女性飞行员所组成的飞行预备部队。虽然队中拥有三鹰亚理莎与羽田美树这二位技术高超的飞官，然而801 飞行队一直未受重视，不但生活起居完全与其他部队隔离，上级长官还一直想藉飞行测试找机会裁撤801飞行队。某日，新到任的地勤官石动拓也因蝙蝠的袭击而误闯飞行员宿舍，不慎看到美树与亚理莎的裸体，当场惨遭二人修理。然而，经过一段时间的相处，向来不合的美树与亚理莎终于被石动的善良所感动，坚强外表下的寂寞芳心逐渐撤防，于是二人为了石动展开一场激烈的较劲……
