《灵境幻世》是拥有超高人气的虚拟现实游戏，其开发者卢危达来自未来。卢危达在未来世界因为诈骗罪而被通缉，他潜逃到现世，用他掌握的未来科技，先于历史开发出灵境空间技术，从而赚取巨额财富。卢危达的真正目的是让游戏中的怪物基美拉出现在现实世界中，最终统治世界。为了抓捕卢危达，来自未来世界的超时空护卫队派出了灵境巡逻员陆彩风。陆彩风发现大学生龙小峰是合适的人选。龙小峰经过刻苦特训，成长为了一名优秀的战士。与此同时，基美拉开始出现在现实世界，龙小峰的妹妹龙玲玲也受到了卢危达的控制。为了找回妹妹、保卫家园，龙小峰开始了讨伐游戏中穿越而来的各种怪物的艰巨挑战。

击败终极歼灭者后，海阳博士为帮助众人返回现世空间而启动聚核基因石，却不慎引起能量爆炸。爆炸的基因石碎片进入了不同的空间缝隙，引起空间缝隙能量失衡，导致大量时空异常现象出现。为避免时空交错，引发空间混乱，海澄与变形联盟四位成员开始寻找并修复出现的空间缝隙。而另一边，浩肯星一方也派出精锐部队来到地球，旨在抢夺基因石碎片能量，消灭变形联盟。面对修复空间缝隙的艰巨任务，面对来自浩肯星的新的敌人和威胁，海澄和变形联盟成员毫不退缩，全力以赴。他们凭着过人的机智，同伴间的信赖，以及面对强敌的勇敢无惧，粉碎了敌人的一系列行动计划，击倒了强大的对手，最终守护了时空的平衡与地球的和平。

三尊苏醒，孙悟空助天神度过危机。西行小队离散后，沙悟净下阴界救师父;八戒在黑水镇因过失而害死人;白狼小羽在恐怖森林收服一虎，又在古城被石兵围困，三藏等人归来解围，却又遇上暗影天王，悟空归队助战。三藏化解亡魂怨恨，西队亦告别故人，继续上路。