2071年的万圣节前夕，火星上的大城市突然发生了令人惊叹的犯罪。高速公路上一辆油罐车爆炸了。事故发生现场的人们因不明原因病倒，死伤人数超过400人。这样大规模的杀人事件，似乎是不明来源的生物武器所为。为此，火星政府发布了3亿圆的赏金悬赏恐怖分子。目击事件的faye单独行动妄图独占赏金，艾德使用黑客技术找到线索，与Bebop号上的大家一起行动。四人一狗组合再次出动，但他们不知道，这3亿元的代价，是对抗前所未有的强大犯罪者。

　　这天，15岁的少年占美阴差阳错的得到了一张球状星空藏宝图。这张地图记录了宇宙海盗搜刮来的巨额财宝的埋藏地点，于是少年占美踏上了一艘巨大的太空帆船，他的太空历险由此开始。
　　占美遇到了船上的厨师约翰，在约翰的帮助下，占美学习到了很多太空人的知识。在一系列的太空历险与战斗中，占美逐渐掌握在太空生存的技巧与法则。当他们越来越接近宝藏时，占美慢慢发现原来自己一路上的好朋友约翰原来是一个阴险狡诈的海盗。面对朋友的背叛，占美将如何是好？

　　人类企图修改植物的遗传因子，以此达到控制植物的目的，而计划失败，树木则渐渐产生了思想，开始了无节制的生长，使得地球遭到了毁灭性的破坏。时间荏苒，在遭到树木袭击后，残留下的人类为求生存选择了和森林和平相处。直至一天，阿基德（胜地凉 配音）与好友凯因（滨口优 配音）偷偷溜进了禁忌之泉取水，在那里，阿基德发现了一个闪耀着光芒的东西，以及沉睡在其中的少女图拉（宫崎葵 配音），阿基德唤醒了沉睡的图拉，交谈中得知她是三百年前的人类。“中立都市”的人们十分友好的款待着图拉，但森林却像怪兽一样对她展开了攻击。就在此时，与森林敌对的都市“莱克那”来了一个自称来自过去的男人修那克（远藤宪一 配音），声称图拉是让世界恢复的关键，这究竟是怎么一回事呢？等待这他们的宿命又是什么……

　　御茶水工业大学生早乙女和也，因恶友南原耕太郎的阴谋赠送的病毒CD发作、试图抵抗之下，居然莫名奇妙的连结到生化达因公司网站，还误订了生化娃娃（Cyber Doll，简称CBD）。快递员送来了生化娃娃小梅，开启了和也与小梅的故事。
　　生化达因公司所制造的生化娃娃，会睡觉、吃东西、看电视连续剧会感动得伤心流泪，外貌、个性、行为反应，各方面都和人类几乎没有差别。尺寸有六分之一大小的小梅，也有真人等比例的莎拉、小惠、与麻美。几乎都是美女，身材性感火辣，各有自己独特的魅力，再加上房东女儿小霞，真是美女云集，当然也有不少养眼服务观众的画面镜头罗！

　　娇小害羞的千濑（前田亚季 饰）一直暗恋着同班同学修次（洼冢俊介 饰），终于，在鼓起勇气向修次表白之后，千濑和修次之间纯白的爱情之花绽放了。一天，札幌的上空突然飞来了大量的轰炸机，战争开始了，也就是从那时起，修次发现了深藏在千濑体内的秘密——向来人畜无害的千濑竟然被军方残忍的改造成为了“最终武器”。
　　尽管心中充满了恐惧与不忍，但只要遭到了攻击，千濑的身体就会不受控制地做出自卫反击，就这样，在短暂的幸福之后，千濑绝望而又无助的，作为兵器的余生开始了。看着身体和心灵都千疮百孔的女友，修次无法说出宽慰之语，他只能通过行动，默默的陪伴在千濑的身边。

　　两位生活在正在进行迁都计划的巴鲁海特帝国的青年——努力从事运输工作有点胆小的伊努玛尔，帝国的新手士兵不懂人情世故的雷欧卡迪欧。一人想着重要的妹妹，一人想着作为士兵的前途，就这样在帝都生活着的日常。与此同时，过去将世界大多数生物消灭、给世界带来凶暴魔物的灾祸“光”将再度降临的预言出现在帝国中，帝国上下人心惶惶。在此之中，以某次密输事件为契机，伊努玛尔与雷欧卡迪欧的命运，以及帝国的历史都将发生激变。

　　21世纪初，人类将多数人留在被哥斯拉蹂躏的地球上，仅使被选中的人们乘上恒星间移民船·阿拉特拉姆，前往能够移居的“约定之地·τ星e”。但这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距离亚空间航行所引发的时空歪曲，导致人类回到的地方变成了“两万年后的地球”。在这个地球，主人公·晴男等人在遭受哥斯拉袭击的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的异星人共同实行谋划了20年的“对哥斯拉战术”，通过殊死战斗成功击倒了哥斯拉。
　　但喜悦并未持续多久，深藏地下的真正哥斯拉“哥斯拉·地球”现身了。两万年间持续成长生存、身高300米、质量超过10万吨，在进化成这种姿态的超巨大哥斯拉压倒性的破坏力面前，晴男等人落花流水。
　　拯救了晴男的是被视为人类的残存者“弗图亚”之民，米亚娜。弗图亚是他们在这个地球首次遇到的人型生命种族。他们会是人类的子孙吗——。“弗图亚的神也被哥斯拉击破，如今只剩下卵。挑战者、抗争者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这样的他们，晴男回应道“这是以人类的双手夺回地球的最后机会了”。
　　另一方面，比尔沙尔德的指挥官·加尔格，注意到弗图亚使用的箭头是由“自律思考金属体·纳米金属”所制造而欢喜。这和21世纪他们在富士山麓作为“对哥斯拉决战兵器”所开发、在启动前遭到破坏的“机械哥斯拉”由同种物质所构成。这正是当时的开发设备至今仍然残存的证明——。

　　被称为木星蜥蜴的神秘敌人第一次袭击地球是在2195年，面对拥有压倒性力量的敌人，地球军束手无策，火星连同殖民地一起落入敌人手中。这就是“第一次火星会战”
　　一年之后，为了夺回火星，民间组织尼鲁加路重工以最新的科技造出新型战舰NADESICO号，召集来的船员包括以年轻的女舰长御统由利加为首，她青梅竹马的朋友，身兼厨师和机师的天河名人，其他船员虽然各有所长，但人格和来历都有一点问题。
　　在战斗变得白热化之际，一个重大的真相被揭发了，敌人原来是100年前被放逐到木星的地球人子孙。他们想得到能够令其运用来往行星间的瞬间移动技术，玻色子跳跃的火星遗迹。
　　跟木连的和谈以失败告终，为了争夺火星的遗迹，NADESICO、木连和尼鲁加路的三方混战开始了，到此为止，是地球跟木连战斗的历史，后来，地球和木连结盟，宇宙总算恢复和平，以上是TV版的剧情。

　　高宫菜穗（花泽香菜 配音）是一个平凡的高中二年级女生，性格温柔总是替别人着想的菜穗非常受朋友们的喜爱。一天，菜穗意外的收到了一封信，让她不敢相信的是，这封信的署名人，竟然是10年后的自己。
　　虽然菜穗不相信这超自然的展开，但还是认认真真的阅读了信件的内容。信里说，菜穗的班上会新来一位名叫成濑翔（山下诚一郎 配音）的转校生，而菜穗会喜欢上翔。更让菜穗感到震惊的是，信中还记录了翔会在17岁那一年出车祸死去的事件，虽然目前的菜穗甚至都不认识这个叫翔的男孩，但万一信上的内容是真实的，菜穗该怎么办呢？

　　来自异次元的种族MU占领了东京，并将城市隐藏在巨大的防护壁之后，他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外，名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。某日，在同MU激烈交火之时，一位名为神名绫人（下野紘 配音）的平凡少年意外的来到了位于东京湾的地下神殿之中，在这里，绫人见到了巨型机器人“Rahxephon”，并且成为了它的驾驶者。
　　在神秘女子的紫东遥（久川绫 配音）的带领下，绫人来到了防护壁之外，加入了TERRA，并且在那里遇见了名为如月久远（桑岛法子 配音）的女子。MU组织对TERRA发起了进攻，当TERRA的存亡陷入危机之中时，绫人再一次驾驶着Rahxephon，成为了这个组织的救世主。

　　在战斗的最后取回了自己的世界，各自回到自己应在之处的Gatchaman=健、Tekkaman=城二、Polimar=武士、卡辛=铁也四人。
　　但他们为了某个目的，而和笑一同再次跨越时空，降临同一个世界。
　　那里，是威胁和平的人类之敌“恶魔党”大施淫威，与之对抗的Gatchaman率领的“科学忍者队”不停战斗的世界。
　　但，在对于这个世界的样子感到违和感的他们面前，一个男人的身影出现了。那是科学忍者队的创设者南部博士。对本应相识的健露出诡异表情的南部，向英雄们说出了意想不到的话语。“看来你们似乎是我的敌人”……。
　　此外，还有一个一直在楼顶窥视他们的身影。那是曾和健一同并肩对抗恶魔党的，科学忍者队No.2。
　　其名为“神鹰乔”。
　　四大英雄的全新激斗，将在银幕上拉开帷幕！

　　小女孩欧吉蒂（又译：吉茜娜）因好奇而带着大肥猫走进座钟后的迷宫之门，在广阔的迷宫通道里追随着白衣小丑的影子，就此成为两个故事的旁观者。这两个故事一个关于世界知名的赛车受杰克?休，他汽车拉力赛中的死因成迷：另一个关于被派往444号工程传达停工命令的杉冈勉，身处大量失控机器人中的他是工程中唯一的人类，当他决定毁掉一切阻止工程的时候，上司却发来了可继续支持工程的命令……
　　原名《Manie—Manie  迷宫物语》。是一部实验性质的动画作品，由《迷宫物语》、《狂奔的男人》、《工事中止命令》三个小故事组成，各部分风格迥然不同，情节也各自独立，因此作品整体谈不上完整的情节叙述，只以小女孩为视线贯穿鲜有对白的群片。
　　片中的每个故事由不同的制作人员负责，因此从人物设定到表现手法及配乐都大相径庭。全间充斥着语言般的隐喻，超现实与写实的表现手法互相融合，使作品从始至终弥漫着一种迷离而诡异的氛围。此外，3个部分的映像效果都十分精美，对细节的把握也十分出色。

　　一个名为“阿卡姆”的民间组织受到远古文明留下的讯息启发而成立。旨在保护及封印超古代文明的危险遗迹。加入“阿卡姆”的特殊工作人员，人们称之为SPRIGGAN。其中实力No.1的特工是一位叫作御神苗优（森久保祥太郎 配音）的十七岁少年。在土耳其的一次调查工作中，“阿卡姆”竟无意地发现了诺亚方舟。方舟隐藏着毁天灭地的神秘力量，于是很多组织都开始窥伺这个传说中的远古遗迹。美国派出了半机械改造人小队与“阿卡姆”展开激烈的遗迹争夺战。而其中一个以神自称的改造人少年竟想私自利用挪亚方舟引发第二次洪水灭世……御神苗优是否能够阻止这一疯狂的计划呢？世界将会走向灭亡吗？

　スペシャル・デザイン：吾妻ひでお、いがらしゆみこ、いしいひさいち、大友克洋、高野文子、高橋留美子、竹宮惠子、とり・みき、鳥山明、細野不二彦、御厨さと美、和田慎二

　　因战争连年，地球环境遭到破坏以致频临灭亡，人类被迫离开地球，五百年来一直生活在巨大太空船内的城市中；主控城市的电脑系统为免人类重蹈覆辙，特意隐瞒实情，让人类生活在虚拟二十世纪的社会中。飙车族矢作省吾从不关心社会及世界事物；他与同伴每天都在玩乐及飙车。直至有一天，他的一位旧朋友把一部神秘的超级电单车留了给他。这部名叫格兰度的超级电单车原来隐藏着一个重大的秘密。利用这部电单车，省吾发现了人类原来一直生活在巨大的太空船内，由一部名叫巴哈姆的超级电脑系统操控着…